「ウーパールーパー（アホロートル）ゲノム解読

「ウーパールーパー」の名前で親しまれている「アホロートル」のゲノム（全遺伝情報）を解読したと、独マックス・プランク研究所などのチームが英科学誌ネイチャーに発表しています。塩基配列はヒトの１０倍を超える約３２０億塩基対で、高い再生能力や進化の謎を解明する手掛かりが得られると期待されています。

「ウーパールーパー」は両生類のトラフサンショウウオ科に分類され「メキシコサンショウウオ」の別名でも呼ばれています。けがなどをした際の修復・再生能力はヒトと比べ圧倒的に優れており、四肢だけでなく心臓や眼球も再生することができます。

その能力の秘密を分子レベルで突き止めるには、基盤情報となるゲノムの解読が必要になる。しかし、近年普及した「次世代シーケンサー」という効率的な解読装置でも、長大な遺伝情報を読むのは困難でした。

チームはより長い配列を処理できる最新の「第三世代シーケンサー」を利用。断片化された配列をつなげてゲノムを復元する計算手法を開発し、ゲノムの位置を特定する最新の手法も駆使することで、巨大ゲノムの解読に成功しています。